More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2874 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 305 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  95.59 
 
 		 295 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  94.24 
 
 		 295 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  95.7 
 
 		 256 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0610  helix-turn-helix, AraC type  43.97 
 
 		 259 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  38.6 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 241 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 272 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 271 aa  165  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 247 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 258 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  37.19 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  36.13 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 263 aa  162  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  38.52 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  38.52 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  40.25 
 
 		 260 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  41.08 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 450 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  37.89 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 259 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 256 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  37.34 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  35.66 
 
 		 268 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  35.74 
 
 		 248 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 259 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 275 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 283 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 267 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0054  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  34.47 
 
 		 281 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  35.62 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  35.08 
 
 		 280 aa  148  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  33.33 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2217  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471705  normal  0.0945315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7867  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  36.12 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0038  AraC family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.175935 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 261 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>