More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3602 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  554  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 278 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 272 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 263 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  33.46 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0401  putative transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  34.43 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  33.2 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  31.64 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2443  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  32.61 
 
 		 240 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 241 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4909  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4644  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422657  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  35.86 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4730  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  34.84 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  36.04 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  35.44 
 
 		 262 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 287 aa  151  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 293 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 293 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0303  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  33.47 
 
 		 296 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  36.94 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  34.44 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  31.69 
 
 		 281 aa  148  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4852  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 450 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  34.63 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  32.31 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0891  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0541662  normal  0.561597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  32.46 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 273 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  32.88 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 282 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04860  hypothetical protein  36.94 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>