More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5828 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  527  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  57.2 
 
 		 266 aa  265  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  56.4 
 
 		 266 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  55.6 
 
 		 266 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  55.6 
 
 		 266 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  50.61 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 257 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 257 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  44.81 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  46.86 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  45.12 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  45.12 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  42.73 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 288 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5292  AraC family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 262 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 263 aa  191  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  41.8 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 265 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  38.4 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 		 262 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  43.27 
 
 		 270 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  38.01 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  39.37 
 
 		 273 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 287 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 244 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1291  transcriptional regulator, AraC family  38.68 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  38.29 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 297 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  40.72 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 293 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 293 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 322 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  41.44 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 450 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  41.06 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  40.08 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 311 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  39.74 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 293 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 293 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 293 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  40.51 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  40.76 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  37.5 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>