More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2116 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  48.97 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  43.46 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  43.46 
 
 		 262 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  45.96 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 257 aa  178  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  40.53 
 
 		 265 aa  177  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  40.51 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  40.08 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  42.53 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  39.91 
 
 		 278 aa  162  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 287 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 287 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 287 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 287 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 287 aa  161  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 450 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 293 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 293 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 293 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 311 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  39.73 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 263 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 333 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 279 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  38.6 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  38.33 
 
 		 299 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  37.28 
 
 		 246 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 267 aa  151  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 291 aa  151  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 271 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  40.08 
 
 		 270 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  39.37 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  38.94 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 294 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  39.37 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  37.56 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 261 aa  144  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 322 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 263 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 255 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>