More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3097 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  43.29 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 262 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  40.79 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  40.79 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 293 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 450 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 263 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  39.59 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  36.82 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  36.4 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  39.91 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 244 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 247 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 262 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  37.55 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  36.78 
 
 		 264 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  38.91 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  40.08 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 280 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  37.4 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  37.82 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  35.95 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  34.43 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  38.81 
 
 		 246 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 283 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  31.97 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  33.85 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3731  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 253 aa  139  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 273 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2339  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>