More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2493 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 299 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  94.77 
 
 		 333 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  81.2 
 
 		 294 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  74.73 
 
 		 311 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  71.23 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  71.23 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  74.54 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  74.54 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  71.23 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 292 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  74.41 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  74.41 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  74.41 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  74.41 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  74.41 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  74.41 
 
 		 297 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  74.41 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  74.02 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  61.24 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  60.92 
 
 		 265 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  60.92 
 
 		 265 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2217  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471705  normal  0.0945315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0054  transcriptional regulator, AraC family  47.19 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 286 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0038  AraC family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.175935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0058  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  40.71 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  43.46 
 
 		 262 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0082  AraC family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  43.04 
 
 		 262 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3761  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 262 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0240  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  41.84 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7122  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  42.08 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  41.84 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4092  AraC family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  43.11 
 
 		 285 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0254  transcriptional regulator, AraC family  42.04 
 
 		 264 aa  168  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 275 aa  165  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  40.42 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 263 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0482  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 264 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4654  transcriptional regulator  38.93 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 257 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 270 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  38.79 
 
 		 295 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  37.34 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 257 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  35.98 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 271 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  39 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  39.92 
 
 		 264 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.15 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  37.13 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  39.11 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 236 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 277 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>