More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1849 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 286 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 267 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2217  AraC family transcriptional regulator  49.81 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471705  normal  0.0945315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0054  transcriptional regulator, AraC family  47.6 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0038  AraC family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.175935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0082  AraC family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0058  AraC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 309 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 311 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 450 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  41.44 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  41.44 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  41.04 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  40.71 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 241 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.95 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  32.67 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  39.83 
 
 		 246 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  35.08 
 
 		 305 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  34.55 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  36.99 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3761  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  33.73 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  38 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  37.83 
 
 		 263 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  33.06 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  40.25 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 		 270 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 256 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 		 280 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4654  transcriptional regulator  37.6 
 
 		 262 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  29.31 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0482  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  37 
 
 		 236 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 236 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0254  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  37.12 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  37.55 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0240  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>