More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2721 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
272 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  93.38 
 
 
272 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  93.38 
 
 
272 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  92.65 
 
 
272 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  92.28 
 
 
272 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  47.08 
 
 
260 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  44.22 
 
 
262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  46.69 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  43.85 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  41.04 
 
 
263 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 
265 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 
265 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
247 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  39.32 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  40.08 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  37.6 
 
 
287 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 
261 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 
292 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  40.24 
 
 
267 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 
293 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 
293 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 
311 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 
268 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
287 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
287 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
287 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
287 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
297 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
287 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
322 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
259 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  38.58 
 
 
303 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  40.39 
 
 
259 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  39.61 
 
 
259 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 
259 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 
450 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 
272 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 
262 aa  166  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  38.96 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.66 
 
 
277 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  37.28 
 
 
278 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 
299 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
333 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
287 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 
282 aa  158  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  40.89 
 
 
263 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 
262 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 
262 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 
273 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 
262 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  39.51 
 
 
270 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  36.4 
 
 
295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 
257 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
275 aa  155  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  36.1 
 
 
296 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 
256 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 
265 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  35.48 
 
 
278 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
258 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 
265 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 
283 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2766  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 
265 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0610  helix-turn-helix, AraC type  34.84 
 
 
259 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  34.54 
 
 
280 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 
283 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 
265 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  36.4 
 
 
295 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 
279 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 
259 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  33.47 
 
 
264 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 
283 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  36.32 
 
 
267 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  34.13 
 
 
268 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  35.55 
 
 
286 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  40.6 
 
 
270 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 
257 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
273 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
273 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 
273 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 
280 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 
278 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
278 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4644  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422657  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1171  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 
268 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384814  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  32.79 
 
 
267 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2217  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471705  normal  0.0945315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  34.54 
 
 
262 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  34.54 
 
 
262 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>