More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2538 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7867  transcriptional regulator, AraC family  45.67 
 
 		 267 aa  230  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1529  AraC family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 266 aa  228  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7861  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 260 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  38.34 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 295 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  35.6 
 
 		 295 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 283 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  34.6 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  34.6 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2766  transcriptional regulator, AraC family  34.27 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 267 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  33.74 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 293 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 265 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 293 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  34.94 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 293 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 450 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 247 aa  144  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  35.74 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 273 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 293 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 293 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0054  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  33.2 
 
 		 267 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1291  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4730  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 		 292 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  34.78 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 311 aa  138  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  31.35 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4644  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 262 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422657  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4852  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  33.48 
 
 		 278 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0038  AraC family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 288 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.175935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  33.78 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0610  helix-turn-helix, AraC type  34.84 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4909  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033682 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 275 aa  135  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  35.27 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 266 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 266 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>