More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5145 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  58.68 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  52 
 
 		 260 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  44.84 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  50.22 
 
 		 253 aa  181  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 257 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  44 
 
 		 262 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  43.24 
 
 		 265 aa  178  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 263 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 257 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  42.67 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  40.26 
 
 		 262 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 291 aa  168  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  40.26 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  41.33 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  46.61 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  41.07 
 
 		 259 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  40.89 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  42.73 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  38.94 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 272 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 275 aa  162  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 288 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 283 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 292 aa  161  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 283 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  39.91 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  38.12 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  40.17 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  39.91 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  41.26 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 293 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 293 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 293 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  38.5 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  38.57 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  37.1 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5292  AraC family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  35.74 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 287 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 450 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13867  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  36.91 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 267 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  37.22 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>