More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31220 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  47.15 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  47.37 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13867  AraC family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2338  AraC family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 263 aa  178  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317534  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.79 
 
 		 259 aa  175  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3142  transcriptional regulator, AraC-family  44.34 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  41.26 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  39.3 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 247 aa  149  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 272 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 275 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  35.62 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 265 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 267 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  39.21 
 
 		 265 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  36.17 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  37.23 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  39.15 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  41.15 
 
 		 264 aa  138  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  34.91 
 
 		 305 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  35.78 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 		 258 aa  135  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 280 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  37.33 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  34.22 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1291  transcriptional regulator, AraC family  33.92 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  35.81 
 
 		 260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 		 273 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  38.16 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  33.62 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  37.02 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 236 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  34.89 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  34.75 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  38.4 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 322 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  36.77 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>