More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2982 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 273 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  78.54 
 
 		 274 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  77.82 
 
 		 284 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  67.34 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  64.4 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  62.98 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  62.7 
 
 		 274 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 325 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 325 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  60.73 
 
 		 294 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  52.85 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  52.44 
 
 		 268 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  51.98 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  47.86 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  52.02 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  52.82 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  52.82 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  49.59 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  52.42 
 
 		 269 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 273 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 261 aa  261  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  52.02 
 
 		 273 aa  259  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  51.81 
 
 		 272 aa  259  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  52.42 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  45.35 
 
 		 269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  47.39 
 
 		 262 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  46.61 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 263 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  45.02 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  45.45 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 284 aa  221  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  45.78 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  43.25 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 266 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 279 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 277 aa  188  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 257 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 275 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  38.06 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  40.09 
 
 		 278 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 270 aa  165  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  36.11 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 287 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  36.49 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  38.12 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5531  transcriptional regulator, AraC family  37.85 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.25231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  36.03 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  37.22 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.96 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  36.16 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  36.16 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 262 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1128  AraC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  38.84 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  36.55 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>