More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1128 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1128  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5531  transcriptional regulator, AraC family  85.14 
 
 		 249 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.25231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  38.58 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  42.27 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  45.37 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 325 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 325 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  35.74 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  36.22 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 247 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 294 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 270 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 273 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  36.69 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 280 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  34.1 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  42.5 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  40.45 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  40.37 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  38.33 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 267 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  37.05 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  37.9 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  38.91 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 259 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  40.08 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  35.77 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  31.98 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  42.33 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  38.67 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 265 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 272 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  39.91 
 
 		 248 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  41.63 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  39.63 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  37.2 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  37.27 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 		 272 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 271 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 271 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 271 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0944  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 294 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>