More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2335 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  80 
 
 		 267 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  70.26 
 
 		 274 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  62.98 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  65.2 
 
 		 274 aa  332  4e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  61.66 
 
 		 284 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  62.15 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  62.25 
 
 		 294 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  61.04 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  61.04 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  52.59 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  52.02 
 
 		 268 aa  261  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 269 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  52.21 
 
 		 273 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  52.21 
 
 		 273 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 273 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 273 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  52.21 
 
 		 272 aa  258  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  49.03 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  51.81 
 
 		 269 aa  255  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 273 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  46.88 
 
 		 269 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 261 aa  244  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 261 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  46.84 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 284 aa  228  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 266 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 266 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  44.44 
 
 		 262 aa  219  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  43.43 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  39.62 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 280 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  44 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  41.5 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  43.87 
 
 		 267 aa  198  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  37.14 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  34.38 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  36.94 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 241 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  40.71 
 
 		 248 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 257 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  39.67 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  39.67 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  38.72 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 273 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 256 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 272 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 303 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  36.77 
 
 		 267 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 322 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  37.45 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  38.5 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 276 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 262 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 247 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>