More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4378 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  565  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  56.97 
 
 		 261 aa  290  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 261 aa  275  6e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  46.25 
 
 		 258 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  46.22 
 
 		 295 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 267 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  43.03 
 
 		 262 aa  224  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  46.15 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 268 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  44.2 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  44.2 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  44.2 
 
 		 272 aa  205  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  40.66 
 
 		 274 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  38.87 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 273 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  38.84 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  40.87 
 
 		 269 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 		 273 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  39.18 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  37.33 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 268 aa  165  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 266 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 266 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 266 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 261 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  35.08 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  33.76 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 262 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  35.4 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  33.76 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 278 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  30.38 
 
 		 260 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2443  helix-turn-helix domain-containing protein  30.74 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 311 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19530  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32 
 
 		 309 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>