More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19530  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  100 
 
 		 309 aa  614  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09710  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  42.91 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.966936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07940  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  42.6 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0767106  normal  0.467358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36360  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  35.29 
 
 		 280 aa  132  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  33.92 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.75 
 
 		 293 aa  129  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  32.92 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19070  transcriptional regulator, AraC family  36.51 
 
 		 279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163333  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2466  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 261 aa  123  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 267 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2316  transcriptional regulator, AraC family  36.1 
 
 		 273 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.870051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  34.51 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5572  transcriptional regulator, AraC family  35.68 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 256 aa  119  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  32.5 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  33.48 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  29.91 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 267 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  30.26 
 
 		 258 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  34.84 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 257 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  30.87 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4909  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033682 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  30.74 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  35.81 
 
 		 255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  25.29 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1856  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0387007  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 273 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  33.62 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>