More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2466 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2466  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 306 aa  598  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2316  transcriptional regulator, AraC family  42.37 
 
 		 273 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.870051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5572  transcriptional regulator, AraC family  42.8 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09710  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  35.92 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.966936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19070  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 279 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163333  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.89 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07940  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.16 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0767106  normal  0.467358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  33.48 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 257 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 246 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 267 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 262 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  36.68 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 241 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 263 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19530  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.94 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.06 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  35.09 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  36.22 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  27.57 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  37.55 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  33.93 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 267 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1576  transcriptional regulator, AraC family  38.81 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  33.81 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 264 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 247 aa  116  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  31.56 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1133  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0106  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0965211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1029  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  29.96 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 278 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0944  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  34.7 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  33.18 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  34.96 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2271  AraC family transcription regulator  38.22 
 
 		 902 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 266 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7867  transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 267 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 266 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 266 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  30.74 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  31.06 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  37.39 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 282 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  31.33 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13867  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.549724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>