More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1576 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1576  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 267 aa  537  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2466  transcriptional regulator, AraC family  38.81 
 
 		 306 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  31.8 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  33.03 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 333 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.1 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5572  transcriptional regulator, AraC family  38.25 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  28.32 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07940  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.94 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0767106  normal  0.467358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 450 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1856  transcriptional regulator, AraC family  31.19 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0387007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09710  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.58 
 
 		 310 aa  105  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.966936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  31.7 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  31.44 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  34.43 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 265 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1128  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 276 aa  99  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  32.41 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  30.34 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3337  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0516036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 287 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 		 246 aa  95.5  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5531  transcriptional regulator, AraC family  46.03 
 
 		 249 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.25231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  27.85 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 278 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 259 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 278 aa  92  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  39.84 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02197  transcriptional regulator transcription regulator protein  29.44 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 283 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  32.08 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2080  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  29.55 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  27.19 
 
 		 265 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>