More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37350 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  100 
 
 		 293 aa  577  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  41.85 
 
 		 263 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09710  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.99 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.966936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 272 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2466  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 272 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07940  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.35 
 
 		 257 aa  152  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0767106  normal  0.467358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 241 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  34.02 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  38.5 
 
 		 246 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  36.77 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  38.67 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  36.64 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  38.22 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  34.39 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  34.39 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 257 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  38.22 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  29.53 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 244 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5572  transcriptional regulator, AraC family  37.99 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 325 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 325 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19530  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.75 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  32.13 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  33.98 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  33.77 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  35.16 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2338  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317534  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  36.09 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  35.14 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  33.03 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  32.13 
 
 		 264 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  34.45 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.65 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  33.63 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3142  transcriptional regulator, AraC-family  36.16 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 276 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4092  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 268 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 271 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 271 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 271 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  34.98 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  32.19 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  32.62 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  33.18 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  33.48 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>