More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09710  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  100 
 
 		 310 aa  605  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.966936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07940  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  43.15 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0767106  normal  0.467358 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19530  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  42.91 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2466  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.99 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36360  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.08 
 
 		 280 aa  152  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5572  transcriptional regulator, AraC family  38.05 
 
 		 251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  33.63 
 
 		 278 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  37.27 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 261 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 257 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 247 aa  125  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 265 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5531  transcriptional regulator, AraC family  35.57 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.25231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  34.73 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  32.74 
 
 		 281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1029  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 280 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0944  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  29.96 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0106  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0965211  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1133  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  32.9 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1128  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 266 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  31.56 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  30.53 
 
 		 295 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.6 
 
 		 259 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2271  AraC family transcription regulator  36.68 
 
 		 902 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 270 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 450 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 256 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 266 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 266 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 255 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3608  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0804414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 260 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3410  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.623928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0891  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0541662  normal  0.561597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  30.29 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  32.14 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1856  transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0387007  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>