More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4553 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 265 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5572  transcriptional regulator, AraC family  73.31 
 
 		 251 aa  354  8.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2466  transcriptional regulator, AraC family  43.28 
 
 		 306 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  40.79 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09710  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  39.82 
 
 		 310 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.966936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 333 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  38.46 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  40.61 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07940  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.36 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0767106  normal  0.467358 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  38.86 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 241 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 297 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  38.01 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  38.01 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 450 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.69 
 
 		 293 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 276 aa  148  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2338  AraC family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317534  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  35.14 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  33.63 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  37.87 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  39.73 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  35.86 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  35.27 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  39.33 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19530  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.85 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1576  transcriptional regulator, AraC family  40.55 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  37.56 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  34.18 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7122  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 276 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  40.25 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  37.29 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36360  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  35.59 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0240  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 288 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  36.36 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  33.05 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1856  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 273 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0387007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  39.42 
 
 		 259 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 274 aa  131  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4092  AraC family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13867  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3142  transcriptional regulator, AraC-family  40.17 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  33.19 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  33.18 
 
 		 269 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.87 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>