More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0415 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 269 aa  549  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  45.35 
 
 		 273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 274 aa  251  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  49.39 
 
 		 264 aa  250  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  45.91 
 
 		 258 aa  248  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 267 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 325 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 325 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 284 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  47.35 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 263 aa  231  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  47.28 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  44.4 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  46.25 
 
 		 295 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  46.64 
 
 		 272 aa  218  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 284 aa  218  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  46.22 
 
 		 273 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  46.22 
 
 		 273 aa  215  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  46.22 
 
 		 273 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  44.62 
 
 		 273 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 261 aa  214  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  46.22 
 
 		 269 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 279 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 263 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  40.39 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  40.42 
 
 		 262 aa  198  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  39.52 
 
 		 278 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  42.41 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  40.87 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 		 282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 275 aa  178  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  41.59 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  32.3 
 
 		 296 aa  151  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 278 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 283 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  36.97 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 293 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>