More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0573 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 264 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4644  AraC family transcriptional regulator  64.06 
 
 		 262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422657  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4730  AraC family transcriptional regulator  62.11 
 
 		 262 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4909  AraC family transcriptional regulator  61.45 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4852  AraC family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 262 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  60.92 
 
 		 267 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  58.4 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 261 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 261 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 261 aa  235  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3337  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0516036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  38.87 
 
 		 276 aa  214  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0401  putative transcriptional regulator, AraC family  37.6 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  41.44 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0303  AraC/XylS family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 263 aa  205  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 273 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 277 aa  195  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1092  AraC/XylS family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1611  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 275 aa  191  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0927  helix-turn-helix domain-containing protein  37.66 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4920  transcriptional regulator, AraC family  40.76 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3843  transcriptional regulator, AraC family  40.76 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.419049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3559  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0961  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0926  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0925  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02197  transcriptional regulator transcription regulator protein  39.92 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3380  transcriptional regulator, AraC family  35.98 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0910  helix-turn-helix domain-containing protein  35.98 
 
 		 258 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3453  helix-turn-helix domain-containing protein  35.98 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3577  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.186564 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  39.76 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  35.97 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  39.38 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  36.65 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  37.6 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 284 aa  151  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  36.4 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  37.34 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 280 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  34.98 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  36.4 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  36.2 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  34.82 
 
 		 305 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  36.77 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  34.82 
 
 		 295 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 259 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 269 aa  141  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  31.29 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  32.55 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  33.78 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.44 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  37.44 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  32.64 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>