More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4920 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3843  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 265 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.419049 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4920  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 265 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_003296  RS02197  transcriptional regulator transcription regulator protein  79.92 
 
 		 271 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  43.6 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1611  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3337  AraC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0516036  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1092  AraC/XylS family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0925  AraC family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0926  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0961  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  38.75 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 257 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  38.91 
 
 		 240 aa  195  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0303  AraC/XylS family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4852  AraC family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0401  putative transcriptional regulator, AraC family  37.92 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4644  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422657  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4909  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 262 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033682 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 261 aa  186  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4730  AraC family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0927  helix-turn-helix domain-containing protein  36.43 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0910  helix-turn-helix domain-containing protein  36.21 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3453  helix-turn-helix domain-containing protein  36.21 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3577  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.186564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3380  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  35.98 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  36.2 
 
 		 292 aa  131  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3559  transcriptional regulator, AraC family  31.12 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  32.02 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 279 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 272 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  33.04 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  34.08 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 268 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7867  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  29.83 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0610  helix-turn-helix, AraC type  31.49 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  31.06 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  32.3 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3761  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  32.44 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  31.33 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3608  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0804414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  30.51 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3410  transcriptional regulator, AraC family  31.44 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.623928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  32.9 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0054  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 306 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3485  helix-turn-helix domain-containing protein  31 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.881194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  30.08 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  29.32 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>