More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5029 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
268 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  90.7 
 
 
266 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  90.7 
 
 
266 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  90.7 
 
 
266 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  89.53 
 
 
266 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  53.04 
 
 
284 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  54.47 
 
 
281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  55.7 
 
 
266 aa  274  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  55.7 
 
 
266 aa  274  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  49.18 
 
 
278 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  47.24 
 
 
280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  47.35 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  48.79 
 
 
267 aa  231  9e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  45.71 
 
 
279 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  46.7 
 
 
264 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  44.03 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  42.91 
 
 
274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 
273 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  44.4 
 
 
273 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  44.4 
 
 
273 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  42.13 
 
 
258 aa  208  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  43.39 
 
 
267 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  47.35 
 
 
292 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  45.37 
 
 
268 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
277 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  41.59 
 
 
284 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  42.04 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  40.47 
 
 
264 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
294 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  42.26 
 
 
263 aa  192  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 
261 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  42.92 
 
 
274 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  41.2 
 
 
269 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  42.29 
 
 
295 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  41.13 
 
 
278 aa  185  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 
275 aa  178  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  41.7 
 
 
275 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  40.16 
 
 
264 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 
272 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 
262 aa  168  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  39.82 
 
 
278 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  39.01 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  37.83 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.01 
 
 
273 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  39.01 
 
 
273 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  39.01 
 
 
273 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  42.41 
 
 
270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  36.44 
 
 
273 aa  165  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  38.57 
 
 
272 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  39.59 
 
 
262 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3853  transcriptional regulator, AraC family protein  33.93 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2513  transcriptional regulator, AraC family  38.57 
 
 
269 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  39.59 
 
 
262 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  37.28 
 
 
303 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
277 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
277 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  37.28 
 
 
322 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 
283 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 
283 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
259 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
277 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  40.93 
 
 
247 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  35.55 
 
 
283 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
257 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
272 aa  158  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  37.95 
 
 
283 aa  157  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 
263 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
257 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 
264 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
256 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 
261 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 
270 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
278 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 
288 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
268 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  36.09 
 
 
296 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 
263 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  36.2 
 
 
267 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  36.2 
 
 
264 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  39.34 
 
 
255 aa  148  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 
261 aa  148  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.76 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  32.27 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  36.68 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>