More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3347 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 283 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  99.65 
 
 		 283 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  91.87 
 
 		 283 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  99.23 
 
 		 259 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  86.93 
 
 		 303 aa  500  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  86.93 
 
 		 322 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  75.49 
 
 		 257 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  42.91 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  42.91 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 255 aa  205  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 261 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 256 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  43.55 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 277 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 275 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  38.87 
 
 		 262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 271 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 272 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 266 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 266 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  40.98 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  41.32 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  40.53 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  39.92 
 
 		 278 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  40.16 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  40.56 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 285 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  38.82 
 
 		 267 aa  168  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 261 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 287 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  39.21 
 
 		 248 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  37.04 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  37.72 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  35.22 
 
 		 281 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  40.65 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  37.45 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.27 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 266 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 278 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  35.68 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  34.77 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 267 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 297 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 253 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 295 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 264 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>