More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3150 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  548  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  34.26 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  34.26 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  37.1 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  36.4 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  32.95 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  36.52 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 279 aa  164  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  37.56 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 262 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  32.24 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  36.44 
 
 		 270 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  36.33 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  34.73 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  33.89 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 311 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  34.78 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 261 aa  155  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 450 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  34.52 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 260 aa  152  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 280 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 		 282 aa  151  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1171  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 284 aa  148  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>