More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1991 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
287 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  94.77 
 
 
287 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  94.77 
 
 
287 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  94.77 
 
 
287 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  94.77 
 
 
287 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  94.77 
 
 
297 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  94.77 
 
 
287 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  94.43 
 
 
450 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  82.31 
 
 
293 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  82.31 
 
 
293 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  78.06 
 
 
292 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  79.63 
 
 
311 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  75.79 
 
 
293 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  75.79 
 
 
293 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  75.79 
 
 
293 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  74.8 
 
 
333 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  74.41 
 
 
299 aa  391  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  75.3 
 
 
294 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  60.96 
 
 
268 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  59.61 
 
 
265 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  59.22 
 
 
265 aa  294  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  51.91 
 
 
267 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2217  AraC family transcriptional regulator  47.91 
 
 
280 aa  235  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471705  normal  0.0945315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  49.64 
 
 
286 aa  235  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  49.8 
 
 
273 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0054  transcriptional regulator, AraC family  48.3 
 
 
306 aa  225  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0038  AraC family transcriptional regulator  49.62 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.175935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  44.36 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 
271 aa  208  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0058  AraC family transcriptional regulator  45.77 
 
 
309 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  44.59 
 
 
262 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  45.13 
 
 
262 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0082  AraC family transcriptional regulator  47.92 
 
 
304 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  42.5 
 
 
256 aa  191  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  45.34 
 
 
285 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  42.98 
 
 
241 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  39.26 
 
 
272 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  39.26 
 
 
272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 
272 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 
272 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  37.6 
 
 
272 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  42.62 
 
 
288 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 
287 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  43.61 
 
 
257 aa  178  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3761  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 
262 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  43.33 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  40.41 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  42.21 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  41.84 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0254  transcriptional regulator, AraC family  42.23 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  41.39 
 
 
264 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0240  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 
285 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
279 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 
247 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0482  AraC family transcriptional regulator  43.28 
 
 
264 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4092  AraC family transcriptional regulator  43.22 
 
 
267 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  42.97 
 
 
262 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 
261 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4654  transcriptional regulator  42.97 
 
 
262 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7122  transcriptional regulator, AraC family  40.23 
 
 
276 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91221  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  42.2 
 
 
270 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  41.85 
 
 
262 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 
263 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  41.85 
 
 
262 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 
262 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  42.08 
 
 
236 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  37.45 
 
 
265 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  41.39 
 
 
263 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
275 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
262 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  42.45 
 
 
260 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
236 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
322 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 
262 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
303 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  40.69 
 
 
255 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  40.81 
 
 
272 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  39.69 
 
 
260 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
275 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  37.45 
 
 
265 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  45.09 
 
 
255 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 
265 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
271 aa  158  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 
272 aa  158  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 
305 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 
260 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  36.86 
 
 
267 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 
257 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
283 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
277 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 
259 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  38.53 
 
 
278 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 
259 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  38.43 
 
 
296 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  39.57 
 
 
265 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
277 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
277 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 
259 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  34.35 
 
 
295 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>