More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0235 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0482  AraC family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0254  transcriptional regulator, AraC family  50.79 
 
 		 264 aa  254  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  39.43 
 
 		 268 aa  185  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  38.62 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  38.62 
 
 		 265 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  41.52 
 
 		 262 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 293 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 293 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 293 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 271 aa  168  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0054  transcriptional regulator, AraC family  38.7 
 
 		 306 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 450 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 333 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  37.34 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0058  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 274 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 241 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  37.34 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0038  AraC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.175935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  38.68 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  41.77 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2217  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471705  normal  0.0945315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0082  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 280 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3761  AraC family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001035  transcriptional regulator AraC/XylS family  32.51 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  34.78 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 261 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  37.39 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  36.99 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  35.75 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  35.87 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  36.65 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  38.12 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  37.67 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  34.13 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  34.03 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0891  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0541662  normal  0.561597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  37.61 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  36.56 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3485  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.881194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>