More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5363 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  633    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  92.83 
 
 		 293 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  92.83 
 
 		 293 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  92.83 
 
 		 293 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  92.42 
 
 		 293 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  92.42 
 
 		 293 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  90.51 
 
 		 292 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  80 
 
 		 297 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  80 
 
 		 287 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  80 
 
 		 287 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  80 
 
 		 287 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  79.63 
 
 		 287 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  80 
 
 		 287 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  80 
 
 		 287 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  73.27 
 
 		 450 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  74.73 
 
 		 299 aa  411  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  75.65 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  78.09 
 
 		 294 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  57.95 
 
 		 268 aa  293  3e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  58.17 
 
 		 265 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  58.17 
 
 		 265 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2217  AraC family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 280 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471705  normal  0.0945315 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 273 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 280 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0054  transcriptional regulator, AraC family  44.07 
 
 		 306 aa  209  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0038  AraC family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 288 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.175935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  45.02 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0058  AraC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  45.78 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0082  AraC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 241 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3761  AraC family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 272 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0254  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 272 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 272 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0482  AraC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 264 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0240  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7122  transcriptional regulator, AraC family  40.45 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 263 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4092  AraC family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 267 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 263 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  42 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  41.92 
 
 		 262 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  41.92 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  36.02 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4654  transcriptional regulator  41.6 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  39.75 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  43.8 
 
 		 270 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 261 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 236 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 261 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  38.26 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 260 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  39.13 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  38.43 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1291  transcriptional regulator, AraC family  37.83 
 
 		 268 aa  155  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 256 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  38.11 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  42.15 
 
 		 248 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  38.53 
 
 		 278 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 254 aa  153  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 271 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  36.44 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>