More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2424 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  60.24 
 
 		 263 aa  294  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  55.34 
 
 		 256 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  54.69 
 
 		 270 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 288 aa  234  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 277 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  42.06 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 277 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 277 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 271 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  44.21 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 261 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 273 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  35.69 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 292 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  42.79 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 257 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  37.92 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  36.33 
 
 		 281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 257 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 257 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  43.05 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  37.02 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 275 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  37.17 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  37.55 
 
 		 268 aa  158  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  35.24 
 
 		 258 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 262 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 247 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  36.29 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  34.84 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 272 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 272 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  34.75 
 
 		 278 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>