More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_53090 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4654  transcriptional regulator  93.51 
 
 		 262 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3761  AraC family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 262 aa  330  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4092  AraC family transcriptional regulator  57.09 
 
 		 267 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0240  AraC family transcriptional regulator  57.83 
 
 		 285 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7122  transcriptional regulator, AraC family  57.09 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 450 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  40.59 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 292 aa  168  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  40.42 
 
 		 265 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  40.42 
 
 		 265 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 262 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 333 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0058  AraC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  41.83 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2217  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471705  normal  0.0945315 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  37.45 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 283 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 241 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0054  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 306 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 280 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  38.78 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  38.96 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  37.45 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  39.56 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 236 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 257 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  32.93 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  33.47 
 
 		 266 aa  135  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 255 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0082  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 263 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7867  transcriptional regulator, AraC family  36.93 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  35.56 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  33.05 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0038  AraC family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.175935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  37.75 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>