More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3397 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  547  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  99.26 
 
 		 272 aa  544  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  95.96 
 
 		 272 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  95.59 
 
 		 272 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  93.38 
 
 		 272 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  47.08 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  46.3 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  43.85 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 265 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  40.64 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 450 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  40.23 
 
 		 259 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 268 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  39.83 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  38.16 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  36.78 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 295 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  35.08 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  36.55 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  37.55 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 262 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  37.13 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  37.13 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2766  transcriptional regulator, AraC family  31.66 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  38.17 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  39.51 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  34.68 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  34.25 
 
 		 268 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  32.93 
 
 		 276 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0610  helix-turn-helix, AraC type  34.84 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 270 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4852  AraC family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1555  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1171  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 273 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4730  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.36 
 
 		 293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4644  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422657  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  33.6 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4909  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>