More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1235 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 282 aa  580  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2766  transcriptional regulator, AraC family  81.35 
 
 		 265 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1171  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  37.05 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 		 260 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 272 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 259 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  33.98 
 
 		 259 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  34.29 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  34.68 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2538  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  34.17 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 241 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 256 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 266 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 271 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 266 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 291 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  31.38 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  31.8 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  29.3 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 255 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  32.65 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5292  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 261 aa  126  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  30 
 
 		 278 aa  125  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  31.42 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0610  helix-turn-helix, AraC type  30.27 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  31.84 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  32.74 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 311 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 450 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  32.59 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  29.88 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 292 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>