More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4581 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  91.12 
 
 		 259 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  91.12 
 
 		 259 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  90.73 
 
 		 259 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  74.8 
 
 		 267 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  72.4 
 
 		 265 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  72.4 
 
 		 265 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  58.43 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  55.6 
 
 		 263 aa  261  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  52.49 
 
 		 262 aa  252  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 260 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 277 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 277 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 257 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2766  transcriptional regulator, AraC family  36.61 
 
 		 265 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 		 260 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1171  AraC family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 268 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  43.44 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  40.99 
 
 		 248 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  35.27 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  39.45 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  36.78 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  38.29 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 257 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  36.56 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 283 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 266 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 266 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 266 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 293 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 287 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  37.39 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 287 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 287 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 287 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 287 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  36.12 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  35.86 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  39.3 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  41.36 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  35.69 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 265 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 450 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  32.94 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  33.2 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  37.66 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  36.44 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>