More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3337 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3337  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  530  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0516036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  65.34 
 
 		 261 aa  352  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  64.94 
 
 		 261 aa  350  8.999999999999999e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  64.54 
 
 		 261 aa  347  8e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  48.56 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  45.3 
 
 		 240 aa  235  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  43.62 
 
 		 276 aa  232  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 257 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0303  AraC/XylS family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4644  AraC family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422657  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0925  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 259 aa  215  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4852  AraC family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 262 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1092  AraC/XylS family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 259 aa  214  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0401  putative transcriptional regulator, AraC family  41.08 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0926  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4909  AraC family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033682 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0961  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4730  AraC family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1611  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  39.51 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0927  helix-turn-helix domain-containing protein  42.19 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3843  transcriptional regulator, AraC family  40.41 
 
 		 265 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.419049 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4920  transcriptional regulator, AraC family  40.41 
 
 		 265 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0910  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3453  helix-turn-helix domain-containing protein  42.19 
 
 		 272 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02197  transcriptional regulator transcription regulator protein  38.76 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3380  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 276 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3577  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 258 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.186564 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  35.25 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  36.07 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.39 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 		 292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  31.44 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  31 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 274 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 259 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  30.31 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  29.6 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7867  transcriptional regulator, AraC family  31.47 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3559  transcriptional regulator, AraC family  29.75 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  32.75 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  31.88 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  32.47 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  33.46 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0610  helix-turn-helix, AraC type  29.2 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  30.84 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  31.66 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 311 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>