More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0927 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0927  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  536  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0910  helix-turn-helix domain-containing protein  84.11 
 
 		 258 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3453  helix-turn-helix domain-containing protein  84.11 
 
 		 272 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3577  AraC family transcriptional regulator  83.72 
 
 		 258 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.186564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3380  transcriptional regulator, AraC family  82.95 
 
 		 258 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0961  AraC family transcriptional regulator  78.38 
 
 		 259 aa  430  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0925  AraC family transcriptional regulator  77.99 
 
 		 259 aa  431  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0926  AraC family transcriptional regulator  77.99 
 
 		 259 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1092  AraC/XylS family transcriptional regulator  74.9 
 
 		 259 aa  417  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0303  AraC/XylS family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0401  putative transcriptional regulator, AraC family  51.67 
 
 		 264 aa  279  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  50.98 
 
 		 276 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  52.72 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 264 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3337  AraC family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0516036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1526  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1417  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17982  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0365  AraC family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0791032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1611  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  38.74 
 
 		 275 aa  205  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.269856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4730  AraC family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 262 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4852  AraC family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4644  AraC family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422657  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4909  AraC family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 257 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3843  transcriptional regulator, AraC family  36.43 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.419049 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4920  transcriptional regulator, AraC family  36.43 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02197  transcriptional regulator transcription regulator protein  35.8 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3559  transcriptional regulator, AraC family  31.97 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  33.47 
 
 		 265 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  31.49 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  31.11 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 247 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  29.54 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  29.83 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 259 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 279 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  31.06 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 		 295 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 287 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 287 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  28.07 
 
 		 305 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 287 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 287 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 287 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7867  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 450 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  27.8 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 325 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 325 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1529  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01759  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.62 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1853  transcriptional regulator, AraC family  27.57 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0610  helix-turn-helix, AraC type  29.46 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1843  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.34721  normal  0.227218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01747  hypothetical protein  27.62 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  29.91 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  28.29 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>