More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13867 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13867  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  51.08 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  52.42 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3142  transcriptional regulator, AraC-family  49.24 
 
 		 278 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  43.95 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  45.61 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2338  AraC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317534  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  38.05 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  35.74 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  35.36 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 268 aa  135  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0482  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  34.96 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  34.68 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  36.64 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  32.64 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  33.93 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 297 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 287 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 287 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 287 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 287 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 287 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  36.16 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4654  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4909  AraC family substrate binding transcriptional regulator  33.63 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  34.87 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 268 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 450 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  31.39 
 
 		 236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  36.24 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0254  transcriptional regulator, AraC family  38.93 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 268 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001035  transcriptional regulator AraC/XylS family  30.52 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  34.22 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  33.48 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  34.45 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2443  helix-turn-helix domain-containing protein  31.85 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3003  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 256 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  33.89 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4092  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  30.18 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7122  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2857  helix-turn-helix domain-containing protein  34.18 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.611855  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0240  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.47 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0891  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 292 aa  118  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0541662  normal  0.561597 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  31.58 
 
 		 296 aa  118  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  35.19 
 
 		 259 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>