More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3142 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3142  transcriptional regulator, AraC-family  100 
 
 		 278 aa  551  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  64.9 
 
 		 246 aa  325  6e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  50.81 
 
 		 263 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13867  AraC family transcriptional regulator  51.03 
 
 		 263 aa  219  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2853  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  49.78 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  44.34 
 
 		 261 aa  185  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2338  AraC family transcriptional regulator  49.1 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317534  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  43.15 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  39.21 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 333 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  37 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 287 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  36.56 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  35.65 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 450 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  39.5 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 257 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  37 
 
 		 278 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  36.44 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1308  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.998927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  36.28 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  35.71 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  37.99 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 273 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  36.25 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 267 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  33.76 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 262 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 247 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 267 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53090  transcriptional regulator  37.71 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  36.32 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  37.61 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  33.63 
 
 		 264 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  32.62 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>