More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36360 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36360  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  100 
 
 		 280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09710  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.08 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.966936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19530  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  35.29 
 
 		 309 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.183251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  33.19 
 
 		 292 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  29.82 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07940  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.44 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0767106  normal  0.467358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  29.55 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5572  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4378  helix-turn-helix domain-containing protein  26.97 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.735178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2466  transcriptional regulator, AraC family  31.74 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  24.14 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3387  AraC/XylS family transcriptional regulator  31 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1909  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 263 aa  99.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  31.84 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  30.09 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 272 aa  99  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.05 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  29.65 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 450 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 325 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  29.87 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 325 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  30.4 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  27.95 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 333 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  27.95 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 255 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  29.69 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  29.91 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  31.51 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 272 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 270 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 270 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 294 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 322 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 272 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 272 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 236 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 303 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  27.31 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>