More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5531 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5531  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 249 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.25231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1128  AraC family transcriptional regulator  85.14 
 
 		 266 aa  394  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 273 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  38.49 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  37.85 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 268 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  38.31 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 270 aa  158  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  42.27 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 247 aa  155  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 262 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  36.4 
 
 		 278 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 278 aa  148  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 264 aa  148  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 278 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  35.2 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  38.46 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 262 aa  144  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  39.27 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 283 aa  142  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 266 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 265 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  38.99 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 272 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0944  AraC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 294 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 271 aa  138  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 270 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0106  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0965211  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1133  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  38.25 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1029  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5425  transcriptional regulator, AraC family  36.29 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  43.72 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 283 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2271  AraC family transcription regulator  43.5 
 
 		 902 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1402  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1666  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1876  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0415  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>