More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0578 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0578  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0262  AraC family transcriptional regulator  67.45 
 
 		 255 aa  355  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0964  AraC/XylS family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.541857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000422  transcriptional regulator AraC/XylS family  42.97 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342208  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04860  hypothetical protein  45.31 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1081  AraC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  44.44 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  40.31 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3308  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  40.77 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 293 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 293 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 293 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 271 aa  138  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 294 aa  138  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 277 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 450 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  34.84 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  36.61 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  36.94 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2217  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471705  normal  0.0945315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  36.02 
 
 		 280 aa  125  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  34.35 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  33.6 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 303 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  32.6 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  32.16 
 
 		 267 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  32.6 
 
 		 282 aa  118  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3097  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  32.42 
 
 		 296 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1502  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0346176  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 283 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2874  helix-turn-helix domain-containing protein  31.47 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>