More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0262 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0262  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  532  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0578  AraC family transcriptional regulator  67.45 
 
 		 255 aa  355  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 260 aa  238  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 258 aa  228  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  44.75 
 
 		 266 aa  221  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1081  AraC family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0964  AraC/XylS family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.541857  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000422  transcriptional regulator AraC/XylS family  42.47 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3308  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  43.36 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04860  hypothetical protein  43.58 
 
 		 266 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  33.07 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 279 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  32.56 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  32.89 
 
 		 278 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  34.51 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 294 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2217  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471705  normal  0.0945315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 265 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 299 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 287 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 287 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 287 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 287 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 287 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 257 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  32.79 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 293 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  35.65 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 293 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 293 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 293 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 293 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 450 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0235  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 263 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  33.93 
 
 		 280 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  33.93 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1868  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.598218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2110  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0650904 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  30.7 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  31.9 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>