More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0964 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0964  AraC/XylS family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  537  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.541857  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000422  transcriptional regulator AraC/XylS family  70.31 
 
 		 257 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3308  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  64.96 
 
 		 255 aa  351  7e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3275  AraC/XylS family transcriptional regulator  50.58 
 
 		 260 aa  268  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3488  AraC/XylS family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3173  AraC family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3550  AraC family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3172  AraC family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2789  AraC family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.548019  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1198  transcriptional regulator, AraC family  48.63 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3316  AraC family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1081  AraC family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1081  AraC family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04860  hypothetical protein  43.53 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0578  AraC family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0262  AraC family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2692  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  42.47 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4262  transcriptional regulator  37.34 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50040  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.101345  normal  0.0268029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  32.89 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  29.66 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3217  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000309187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2532  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2096  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000553056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1991  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 287 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000491634  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1849  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5363  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000169612  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2619  AraC family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 450 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0177667  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2073  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000233142  normal  0.314085 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6023  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0029418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2054  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000130101  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 292 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  29.32 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1886  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 273 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3418  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2008  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126108 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2339  helix-turn-helix domain-containing protein  32.58 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  29.6 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  33.62 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2455  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2350  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1375  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000191451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  29.78 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48390  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.112276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4458  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  31.9 
 
 		 264 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4553  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  0.506644 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2825  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  28.51 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1923  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2217  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.471705  normal  0.0945315 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1910  helix-turn-helix domain-containing protein  31.03 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0820  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4158  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3608  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0804414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  28.27 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3485  helix-turn-helix domain-containing protein  29.01 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.881194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>