More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1490 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1490  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  397  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107689  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32460  putative transcriptional regulator  43.62 
 
 		 255 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144604  normal  0.396553 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2679  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 268 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 276 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 270 aa  121  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2750  putative transcriptional regulator  38.38 
 
 		 254 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3128  AraC family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 261 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.030776  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3229  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 268 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0822479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1019  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 257 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.477846  normal  0.675465 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 278 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4366  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3279  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 263 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644243  normal  0.0774858 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1773  AraC family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 267 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0125271 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4128  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4238  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0843116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1133  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 280 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0106  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 280 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0965211  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  46.34 
 
 		 264 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1029  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 280 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4134  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 262 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574832  normal  0.554852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3660  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 262 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812139  normal  0.771843 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0944  AraC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 294 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2271  AraC family transcription regulator  38.46 
 
 		 902 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1285  transcriptional regulator, AraC family  34.59 
 
 		 293 aa  98.2  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2055  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 282 aa  97.8  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.727489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01153  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 283 aa  97.1  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 271 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  42.75 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4106  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 272 aa  92.8  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.302836  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  32.79 
 
 		 278 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3397  AraC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 272 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5230  AraC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 272 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0303  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 263 aa  91.7  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 291 aa  91.3  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  42.75 
 
 		 260 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1448  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 257 aa  91.3  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 283 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 277 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001334  transcriptional regulator AraC family  30 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55730  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 267 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0409  AraC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 273 aa  89.4  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001495  transcriptional regulator AraC family protein  30.53 
 
 		 264 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12324  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3448  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 272 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05224  hypothetical protein  29.41 
 
 		 276 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4073  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 272 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0573  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 264 aa  89  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0283  transcriptional regulator, AraC family  35.91 
 
 		 246 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 322 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 279 aa  88.2  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  37.98 
 
 		 257 aa  88.2  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 283 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3644  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 272 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 283 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2721  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 272 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 303 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3870  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37350  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  42.59 
 
 		 293 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 259 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31220  transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  31.96 
 
 		 261 aa  86.7  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  39.34 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 247 aa  86.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0696  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 276 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 257 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 275 aa  86.3  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 257 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  38.4 
 
 		 267 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 266 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 266 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 266 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 263 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 266 aa  85.1  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4855  putative transcriptional regulator  32.16 
 
 		 264 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6507  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 273 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.181119  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3251  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 273 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404361  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 247 aa  84.7  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 292 aa  84.7  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1956  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00233066  normal  0.263741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  36.72 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2086  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000391503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1171  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4912  AraC family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2338  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317534  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  31.21 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2478  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 287 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000123953  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1594  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 287 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000369845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1369  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 287 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000576535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>