85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0274 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  100 
 
 		 111 aa  220  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  46.74 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  47.42 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  50.55 
 
 		 107 aa  96.7  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  47.42 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43 
 
 		 113 aa  94.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.3 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  45.83 
 
 		 130 aa  94  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2408  cupin 2 domain-containing protein  47.31 
 
 		 100 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231406 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  46.15 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.42 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  39.05 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  45.05 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.18 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  38.1 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.71 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.21 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  37.37 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.95 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.56 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.92 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  39.18 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.11 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  37 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1482  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.45 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.336107  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.38 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  33.64 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.38 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  40.96 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  39.25 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.38 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  34.02 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  41.94 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  41.94 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  39.25 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  36.36 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  35.71 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  34.74 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2188  cupin 2 domain-containing protein  34.07 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000987781  hitchhiker  0.00000388875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  30.56 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  39.74 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.57 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  34.88 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.86 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  33 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  35.21 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  31.58 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0506  hypothetical protein  28.44 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0871689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  44.07 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  37.89 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  34.48 
 
 		 155 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1190  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  36.96 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  36.14 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5823  hypothetical protein  35 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410893  normal  0.322015 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.51 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.62 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  27.63 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>