13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5823 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5823  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  214  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410893  normal  0.322015 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0873  cupin 2 domain-containing protein  42.71 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  33.82 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  33.7 
 
 		 111 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  35 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  47.62 
 
 		 152 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>