143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0540 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
113 aa  233  8e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  82.88 
 
 
121 aa  199  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.76 
 
 
111 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.14 
 
 
112 aa  124  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.61 
 
 
112 aa  97.1  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 
113 aa  84.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  38.95 
 
 
111 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0826  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.45 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.78 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  39.56 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  36.17 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.39 
 
 
108 aa  61.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.35 
 
 
117 aa  60.8  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.89 
 
 
107 aa  60.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  37.04 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.04 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.68 
 
 
107 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.66 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.88 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  37.33 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 
116 aa  53.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.97 
 
 
110 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  28.85 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  30.11 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
292 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  30.86 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.67 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.59 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.52 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3664  hypothetical protein  38.2 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.33 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  34.67 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  34.94 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.72 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.48 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.95 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.72 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.04 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  34.94 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 
234 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  31.58 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  34.78 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  25.69 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  25.69 
 
 
110 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  31.87 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  25.69 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  32 
 
 
127 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  33.73 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  33.73 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  30.67 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  32.97 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.66 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.44 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  32.97 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  35.29 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.52 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.072688  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1190  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  34.12 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1723  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.09 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.410123  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  27.66 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  25.23 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  27 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.86 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  32.26 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 
211 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  31.33 
 
 
211 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0445  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.1 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.205887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2333  hypothetical protein  34.83 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  27.27 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.65 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.33 
 
 
136 aa  42.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  31.58 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  32.43 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 
205 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  32.05 
 
 
114 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
273 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.27 
 
 
114 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  28.24 
 
 
139 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>