58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4525 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  303  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  62.07 
 
 		 147 aa  186  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  57.82 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  36 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  36 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.75 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.08 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  31.82 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.15 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  36.56 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.47 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  37.63 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4609  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 229 aa  50.1  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  31.58 
 
 		 338 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.39 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  39.51 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  39.51 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  39.51 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  29.92 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410893  normal  0.322015 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  34.52 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.9 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  28.77 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  31.58 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.75 
 
 		 145 aa  43.5  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  37.66 
 
 		 178 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 		 377 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  39.29 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  28.78 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  31.53 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0913  cupin 2, barrel  32.05 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  27.5 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  31.71 
 
 		 104 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4092  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 267 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  40.82 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5506  hypothetical protein  32.95 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0625  hypothetical protein  26.37 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  28.3 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  38.98 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3142  transcriptional regulator, AraC-family  37.74 
 
 		 278 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.844249  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 257 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>