131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3997 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.05 
 
 
152 aa  191  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  59.72 
 
 
146 aa  186  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  54.36 
 
 
152 aa  184  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  53.85 
 
 
152 aa  169  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  50.68 
 
 
149 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  31.71 
 
 
190 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.17 
 
 
163 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.57 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.54 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  36.49 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  32.61 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.89 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.18 
 
 
181 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 
150 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.23 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  29.82 
 
 
179 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  36.36 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  35.82 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  35.82 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  35.82 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.35 
 
 
204 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  35.82 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.35 
 
 
204 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  35.82 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  35.82 
 
 
120 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  30.28 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  35.82 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  35.82 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  35.82 
 
 
120 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  34.88 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  35.82 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 
294 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.25 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  31.73 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.82 
 
 
112 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07738  hypothetical protein  30.09 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  37.14 
 
 
163 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.29 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.03 
 
 
127 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.76 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.44 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  26.8 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  38.33 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  26.8 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  45.83 
 
 
332 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  44 
 
 
338 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  25.77 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  26.8 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  32.39 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.75 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  35.59 
 
 
186 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  36.62 
 
 
181 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  43.86 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  41.79 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 
163 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.74 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.42 
 
 
182 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  26.56 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 
210 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.06 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.68 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 
180 aa  43.9  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  35.21 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  35.21 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  34.85 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  33.85 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  25.77 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  26.56 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  33.8 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  34.33 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  34.33 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  34.33 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.21 
 
 
332 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  34.33 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  34.33 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  28.99 
 
 
158 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  34.29 
 
 
160 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  34.29 
 
 
160 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 
160 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  31.71 
 
 
134 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 
140 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  35.94 
 
 
159 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 
160 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>